立储的事情是自此定下来了，但对于陈冲来说，要忙的事情还是太多了。
首先是在行政上的阻力。在皇帝不能全力支持的情况下，陈冲在尚书台内受到极多的掣肘，不再有当年一言九鼎的威力。原本构思成熟的政策，在第一次没有通过的情况下，后面几次议论都被拿到外朝上，除了平白引起一些风波外，果然也没有说定。
其次才是战败本身的余波。前线无法总结出建业之战具体的伤亡，但朝廷却必须做出相应的安置。阵亡将士的抚恤如何进行？前线的伤员溃兵如何重整？损失的马匹兵甲如何弥补？这些问题都化作案牍，堆在了尚书台的桌案上。而与此同时，尚书台也必须应对春耕、迁民、漕运、察举、考功等事务，即使陈冲将迫在眉睫的事情单列出来，其余事务一律延后，台中官员也难免为此焦头烂额。
而在朝中议事缓慢的情况下，前线的战事却愈发激烈。此时有四万吴军正在步骘的率领下猛攻合肥，而诸葛亮才刚刚抵达寿春，重新着手布防。淮南此时虽有杜畿两万人坚守，但因为缺少船只和马匹，汉军战意极为沮丧。而更要命的是，淮南出现了春荒，导致盗贼蜂起，四处有乱民流窜，可以说局势大坏。诸葛亮向陈冲上书说，他打算先向青州借粮，同时招抚山贼，等局势安稳下来以后，再可以考虑战况。襄阳那边的形势也不好，周瑜带江陵水师返回荆州后，李恢等人自知不敌，率巴蜀水师返回白帝城。而司马懿原本攻下了当阳、枝江、夷道等地，但在没有水师的情况下，也不敢与周瑜野战，只能收缩兵力，返回宜城一带。此时他上报计划，说汉南不足固守，不如尽迁汉南百姓，而后坚壁清野，只用士家守中卢、襄阳二城。
诸葛亮和司马懿皆是当世雄杰，在军事上独具慧眼。陈冲赞成两人的意见，但是在具体的实施上，却又呈现出两种不同的态度。诸葛亮是陈冲弟子，为人淡泊名利，处事又公正无私，自然得到了陈冲无条件的支持。但对于司马懿，陈冲却呈现出一种纠结的态度：司马懿固然是命世之才，多智果敢，但他性情残忍，又城府极深，一旦按他所说迁民固守，整个襄阳都将受其掌握。对于这种局面，陈冲并不能安心，所以必须做一些后手打算。
这一日，陈冲又到宫中探看天子。在宫中休养了一阵后，天子的精神略微好了些，但身体还是很差。陈冲再见他时，他依旧很瘦，且皮肤出现了明显的黄斑，下腹部还生出了肿块。这导致他只能侧卧着，即使坐起也觉得右肋隐痛。宫中的御医说，就目前的状况来看，陛下得的恐怕不止是心病，还可能是在南征途中，染上了其他的一些疫症。因为尚未查清病因，想要根治更是无从说起，这导致天子迟迟不能重新视事。
但对于重要决策，陈冲还是都与天子讨论，此次事关军国大计，则更是如此。坐定之后，陈冲先对刘燮介绍具体的形势：“陛下，如今战事四起，但最重要的还是汉南一带，此地是南阳门户，一旦丧失，吴贼十日可至京畿，故而不可不慎。而司马仲达前日传信说，周瑜拥众八万，主力已抵达竟陵，前锋更是进入绿林。而南府尚剩军力三万，仅能守城，恐无暇应对民事，他便打算坚壁清野，尽迁民众，固守襄阳……”
陈冲说得很慢，但刘燮却是个急性子，他从中听出陈冲另有打算，就干脆问说：“叔父若有意见或者忧虑，可以直言。”
但陈冲并没有因此被打断节奏，仍然说道：“从军事上考虑，司马仲达所言不虚，既然没有水师，我军也只能任由吴贼往来，若不迁民，百姓反倒为吴贼所掠。可一旦迁民后，汉南诸城便为吴人所遮蔽，半年内难以得援。如此绝境，非得用忠贞坚忍之将才可，我今日来见陛下，就是想要商讨此事。”
刘燮虽然身体不适，但意识依旧很敏锐，他听出来陈冲未能说出的深意：陈冲以为司马懿不可靠，想要临阵换将。这使得他回护说：“叔父还是不喜仲达啊！仲达是我的好友，他虽然做事不仁，但为人还算义气。说不上是贤臣，但说得上是干臣。世上哪有十全十美的臣子？文直忠且仁，也不免奢侈，士元仁且义，却无百里之才。群臣之中，论武略胆识，仲达就是镇守襄阳最合适的人选。”
当然，刘燮也知道自己话说得有些满了，又把话题往回拉了拉，轻声道：“何况还有含贞在襄阳看着，一旦真出了什么事，自有他照看，叔父不必多疑。”
说罢，他艰难起身，督促身边的尚书郎定下回复诏令：同意司马懿的安排，且以司马懿为镇南将军，假节，都督荆州诸军事，以陈璋为襄阳太守兼偏将军，为司马懿之副。大体来看，这算是一个合理的处理，赐司马懿节钺，是显示皇恩厚重，而提拔陈璋为偏将军，一来分司马懿之权，以示敲打，二来也能安抚陈冲，表示尊重丞相的意见。
陈冲确实不能再说什么，但心中还是有极深的忧虑：从才能来看，陈璋远远逊色于司马懿，恐怕并不能起到监督分权的作用，而从年龄上来看，陈璋被提拔得太快，在军中难以服众，恐怕还免不了遭受诽谤，说是受到了自己的余荫。但是看刘燮的态度，自己再多说也没什么用，也只能从别的方面去弥补了。
接下来的一段日子，他便主要着手于上林军的重建。目前此事是由关羽负责，魏延为辅，计划以四年为期，南征的部分残军为班底，恢复禁军的建制。虽说重建是一件长期的事情，尤其是骑军的建设。但考虑到武库中还剩下的武器甲械，想要短时间内拼凑出一支万人左右的弩军，还是可以做到的。在一兵一卒都弥足珍贵的现在，这毫无疑问是一支非常重要的机动力量，将其派往樊城独立相机作战，也算是一个不错的选择。
只是对于弩军将领的任命，陈冲又犯了难。几年远离朝堂后，最大的恶果并非是他疏离了钟繇、法正这些旧人，而是没有再培养足用的新人。这样重要的位置，非得派一个忠勇可嘉、兼具谋略的将领不可。好在这个时候，郭淮率着一支千余人的队伍返回京师，向朝廷汇报此前建业之战的经过。虽说是戴罪之身，但论资历，论出身，郭淮都算是一个合适的人选，陈冲便专门把他叫到府上，专门对他进行一番考察。
两人其实也并非第一次见面，不过却是第一次单独交流。郭淮颇有些坐立难安，陈冲亲自给他斟了一杯茶，安抚他说：“伯济一度身受重围，百死无生，却能跋涉还朝，宫阙待命，一片赤诚可见，有何可怕的呢？看到你能回来，我和陛下都深感欣慰。”
郭淮干笑一声说：“败军之将，丞相就不用安慰了，我也知自己无颜再见陛下，若是有用得上我的地方，我必不推辞。”
见郭淮如此说，陈冲也就不避讳了，直接把襄阳的地图摆出来，对他简述了一番敌我双方的态势后，问他道：“你对司马仲达的布置如何看？”
郭淮思量了一番，谨慎道：“只从地形上看，镇南将军的布置没什么问题。但我此次渡江以后，最大的感受却不在地形，而在天时。”
“哦？你说说看。”
“江南天气变化万端，不似中原平稳，即使在冬日，都能遇上连绵大雨，终日大雾。何况是在春夏雨季？镇南将军打算固守孤城，一旦遭遇暴雨连日，沔水大涨，吴人趁势用水攻破城，我军该如何应对呢？既然没有相应的水师，恐怕没有任何反制的法子。所以朝廷下了迁民的决心，就不妨连军队都撤回沔北，就守在樊城。”
“那襄阳城如何处置？”
郭淮答道：“等吴人来时，就放火烧城，把襄阳烧成一片白地。吴人在雨季也无法修复城池，只能猛攻北岸的樊城，只要守樊城到秋季退潮，他们还无法破城，就只能把襄阳再还给国家。”
陈冲听罢，一时无法言语。迁民本已是不得已之事，而郭淮要把襄阳烧成一片白地，烧起来容易，当年董卓的一把大火，使雒阳至今都没能回到当初的光景，而重建襄阳，又需要多长时间？但战争只讲究成败，从这个角度来说，郭淮的方案无疑才是最佳的方案。陈冲并不是一个喜欢犹豫的人，他很快下定决心，将郭淮任命为积弩将军，在稍作整训后，就带兵去驰援樊城，而后他又传信司马懿，命其尽快做好准备，在迁民的同时，也要准备移军樊城，并拆毁襄阳城池，绝不能使其落入吴人手中。