美国海军由海军和海军陆战队两个独立的军种组成。海军可分为舰艇部队、舰队航空兵、海上勤务部队和岸基部队4个兵种，一般按照行政管理和作战指挥两个系统进行编组和行动。
目前，海军编有两洋舰队，即大西洋舰队和太平洋舰队，11个航母战斗群，10个舰载机联队；主要装备有84艘潜艇、143艘大型水面作战舰艇（含航空母舰11艘、导弹巡洋舰31艘、导弹驱逐舰52艘、导弹护卫舰49艘）、2900架飞机（作战飞机1728架）、1500架直升飞机（含武装直升飞机487架）。
一、舰艇部队
海军舰艇部队包括水面舰艇部队和潜艇部队，均编入大西洋和太平洋两大战略集团。平时属海军作战部领导，战时归各自所在战区的总部统一指挥。两大集团均采用行政和任务两种编组形式。
行政编组：分为水面舰艇司令部和水下舰艇司令部。水面舰艇司令部下辖若干个大队，包括水面舰只大队、巡洋舰驱逐舰大队、两栖舰大队、特种作战大队、扫雷舰大队和供应舰大队等；一个大队又下辖若干个中队，如1个巡洋舰驱逐舰大队由2~4艘巡洋舰和2~4艘驱逐舰中队编成。潜艇部队编制大致相同，只是常规潜舰中队编配4~6艘潜艇，而核潜艇中队可能编配7~10艘潜艇。航母通常编成航母战斗群，隶属于舰队航空兵司令部。
所谓任务编组，即特混编组，是为执行作战、演习、战术训练和某项特定任务而编成的混合舰队。它只负责对所属部队实施战役、战术指挥，不负责其行政事务；所需兵力从各个行政编组抽调，一俟任务完成即归还原行政建制。任务编组按兵力规模分为作战舰队、特混舰队、特混大队、特混小队和特混支队5个级别。
作战舰队是海军的战略军团，可独立实施各种大型战役。美国海军共编有5个大作战舰队。太平洋舰队编有第3（负责太平洋战区）、第7（负责西太平洋战区）和第5（负责印度洋、波斯湾和红海战区）等3个作战舰队，大西洋舰队编有第2（负责大西洋战区）和第6（负责地中海战区）等2个作战舰队。各舰队编制实力大同小异。如：第6舰队编有航空母舰1艘、巡洋舰2艘、驱逐舰3艘、护卫舰2艘、攻击潜艇2艘、海岸巡逻艇2艘，另配有两栖舰艇3艘和铺助舰3艘，共计18艘舰艇。第7舰队共有19艘舰艇，第5舰队共有18艘舰艇。此外，各舰队还有一部分军事海运局的后勤铺助舰船随同作战舰艇活动。
航空母舰是美海军最重要的舰种，常常是海军独立遂行作战任务的核心力量。现编有11艘航母，其中核动力多用途航母8艘，即“尼米兹“级7艘（“尼米兹“号、“艾森豪威尔“号、“卡尔·文森“号、“罗斯福“号、“林肯“号、“华盛顿“号和“斯坦尼斯“号）、“企业“级核动力航母1艘（“企业“号）；常规动力多用途航母3艘，即“小鹰“级2艘（“小鹰“号和“星座“号）和“福莱斯特“级1艘（“独立“号）。
二、舰队航空兵
舰队航空兵也采用行政编组和任务编组两种编成方式。行政编组一般按单一机种编组，负责日常行政管理、飞行训练和物资技术保障等；任务编组是为满足遂行特定任务需要而进行的多机种混合编组。舰队航空兵按行政编组分为联队（大队）、中队和分遣队3级。联队是舰队航空兵的基本行政和战术单位，下辖6~12个中队，并分为舰队航空联队和舰载机联队。舰队航空联队又称岸基航空联队，包括巡逻机联队（由6~7个中队组成，每个中队装有9架P-3C岸基反潜巡逻机）、攻击机联队（由8~14个中队组成，每个中队装有14架A-6E攻击机）、战斗机联队（由10多个中队组成，每个中队装有12架F-14A战斗机）、战斗攻击机联队（由10多个中队组成，每个中队装有12架F/A-18攻击战斗机）、直升机反潜作战机联队、侦察攻击机联队、母舰警戒联队和战术支援联队等。
舰载机联队是以航母为活动基地的行政管理和战术作战单位。目前，美军共编有10个现役舰载机联队和1个预备役舰载机联队。典型的舰载机联队编有2个战斗机中队，各装有F-14A型战斗机10~12架；2个战斗攻击机中队，各装有F/A-18战斗攻击机9~12架；1个战术电子战中队，装有EA-6B电子战飞机数架；1个空中预警机中队，装有E-2C预警机4~5架；此外，航母上还配有KA-6加油机、S-3和SH-3反潜机与直升机数架。
三、海上勤务部队
海上勤务部队主要包括海上支援部队和海上运输部队，现有军人1000人，文职雇员6000人，合同商业人员2500人；拥有由110多艘两栖、后勤和运输舰船组成的核心舰船，按大队、小队和支队编组。
四、岸基部队
岸基部队主要指海军基地（包括舰艇基地和海军航空站）及其所属部队和机构。
五、海军陆战队
陆战队是一支隶属于海军部的两栖作战部队，有自己独立的组织系统，由地面作战部队和航空兵编成。地面作战部队又分为舰队陆战队和安全警卫部队两部分，其中舰队陆战队是海军陆战队的核心力量。主要装备有坦克403辆、轻型装甲车1966辆、牵引炮789门、反坦克导弹发射装置2373具、作战飞机475架、武装直升机156架。
陆战队编有太平洋舰队陆战队和大西洋舰队陆战队。两洋舰队陆战队在行政上归海军陆战队司令部领导，在作战上则归两洋舰队指挥。太平洋舰队陆战队下辖第1（司令部驻地为加利福尼亚洲彭德尔顿兵营）和第3远征部队（司令部驻地为日本冲绳巴特勒兵营），大西洋舰队陆战队下辖第2远征部队（司令部驻地为弗吉尼亚洲勒任兵营），每个远征部队编有1个陆战师、1个陆战航空联队和1个勤务支援大队等。现有第1、第2和第3陆战师共3个现役陆战师，分别隶属于第1、第2和第3远征部队，陆战师的编制员额为18335人（含海军人员约800人），采用三团制编制，按师、团、营、连、排编成；编有师直属部队、战斗部队和战斗支援部队。直属部队编有师营部、侦察营、坦克营、步兵营、两栖突击营和工兵营等；战斗部队为三个陆战团，战斗支援部队为1个炮兵团。
安全警卫部队主要负责海军武装舰船、基地设施和国务院驻外使、领馆的安全警卫工作，兵力约占陆战队总兵力的8%。
陆战航空兵按联队、大队和中队三级编成，共编有3个联队，分别配属于3个远征部队。联队编制员额为12000人，编有4个航空大队、航空控制大队和支援大队各1个，28~31个中队，以及数个轻型防空导弹营和高炮连等地面防空部队。其中要装备有：AV-8B攻击机60架，F/A-18战斗攻击机48架，A-6E攻击机20架，EA-6B电子战飞机6架，RF-4B侦察机8架，KC-130加油机12架，OV-10A/D观察机12架，AH-1T/攻击直升机24架，CH-53直升机48架，CH-46E直升机60架，UN-IN通用直升机24架，“霍克“导弹发射装置16部。
六、海岸警卫队
主要担负港口安全保卫、导航铺助、搜索与救援、缉毒等任务，归运输部领导；战时由海军指挥，担负海上运输舰队护航、执行反潜任务、为海军舰只提供舰员等。编有2个地区司令部（大西洋地区司令部和太平洋地区司令部）和10个海岸警卫区司令部。装备有巡逻舰艇146艘、飞机73架、直升机136架。